L'arrosage en profondeur consiste à irriguer directement le sous-sol, plus ou moins profondément selon les besoins des végétaux, afin de réduire les pertes en eau au plus près des racines.
Pour distribuer l'eau en profondeur, il faut disposer d'un puits d'irrigation constitué d'un conduit enterré aux trois quarts.
Il est évidemment plus facile de l'installer au moment de la plantation, d'autant plus que cela est très profitable aux jeunes plantes.
Cependant, puisqu'à mesure que celles-ci grandissent, leurs racines se développent en s'éloignant du tronc, on peut aussi l'installer après, d'autant que le réseau racinaire d'une plante est à peu près proportionnel au volume de sa ramure.
Il faut définir le diamètre du conduit en fonction du type d'arrosage que l'on adopte.
L'autre objectif de l'arrosage en profondeur est d'encourager la plante à développer ses racines vers le bas, afin d'y trouver à terme une humidité résiduelle qui la rendra, on l'espère, autonome en eau.
Dans un sol privé d'arrosage en surface et recouvert d'un épais paillage organique, les herbes indésirables se font rares, ce qui réduit la concurrence pour l'accès à l'eau.